利息核算會計分錄、應付利息核算總行清算中心按季計算并支付各清算行和省級分行存放在總行的備付金利息。每季度計算支付利息時，會自動生成各清算行和省分行的利息報文，并在次日開始營業時發送給所有銀行。利息核算總行清算中心每季度計算匯總各清算行和省級分行向總行借入的貸款利息。按季收息時，清算行和省分行的利息報文會自動生成，并在第二天開始營業時發送給所有銀行。利息核算清算行和省級分行在收到總行第二天發送的利息報文后，自動進行賬務處理。

清算行和省級分行在總行清算中心的備付金不足以支付貸款利息的，總行先進行強制貸款，再按上述賬務處理扣收利息。省級分行按季向所轄清算行收取貸款利息和支付下撥資金存款利息，可按上述辦理。